一、服務種類
1. Knockout 策略
(1) 短片段移除 Short fragment removal:移除2個gRNA間的DNA小片段 (約100-200bp), 移除後造成exon編碼的鹼基數為非3的倍數,造成基因Knockout 。
(2) 片段位移突變 Frame-shift mutation:gRNA設計在exon上,移除的DNA片段約為1-2bp, 缺失的鹼基數為非3的倍數,造成基因Knockout 。
(3) 整個片段移除 Large fragment removal:將序列上的基因片段完全Knockout。
2. Knockout gRNA plasmids
Ubigene開發了一系列YKO載體,包括慢病毒載體、普通載體和腺相關病毒載體,可廣泛應用於體外或體內。
YKO系列載體 | 載體名稱 | 螢光抗性 |
慢病毒YKO系列載體 | YKO-LV001-single gRNA YKO-LV001-dual gRNA |
EGFP/mCherry可選,Puro/Neo可選 |
普通YKO系列載體 | YKO-RP001-single gRNA YKO-RP001-dual gRNA |
EGFP/mCherry可選,Puro/Neo可選 |
腺相關病毒YKO系列載體 | YKO-AAV001-single gRNA YKO-AAV001-dual gRNA |
EGFP/mCherry可選 |
單一gRNA載體 :
用於Frame-shift mutation或Short fragment removal ,設計2-3個gRNA同時轉染細胞,可提高Knockout效率。
單一gRNA載體 :
用於Frame-shift mutation或Short fragment removal ,設計2-3個gRNA同時轉染細胞,可提高Knockout效率。
3. 學術文獻已使用多種客製化KO cell line,以下列舉
STING1 Knockout in HeLa cell line —— prevention and treatment of viral diseases | IF=32.4 Immunity |
TP53 Knockout in HCT116 cell line——Apoptosis | IF=16.6 Nature Communications |
ZNF432 knockout U2OS cell line——Ovarian cancer drug resistance | IF=14.9 Nucleic Acids Research |
SNORD17 Knockout in HepG2 cell line——liver tumors | IF=12.4 Cell death & differentiation |
Pik3r1 knockout RAW264.7 cell line——Osteoporosis | IF=11.4 Redox Biology |
4. Knockout Stable Cell line 服務詳情
細胞類型 | 腫瘤細胞、常規細胞株、IPS/ES等各類細胞 |
服務類型 | 單基因/多基因 Knockout |
交付規格 | Cell Pool/ Single cell clon |
交期 | 4週起 |
客戶提供資訊 | 細胞株名稱, 基因名稱 (NCBI基因代號) |